Borsista del C.NR. presso Istituto di Chimica del Terreno dal 1970 al 1972. Ricercatore del C.NR. presso Istituto di Chimica del Terreno dal 1972 al 1986. Professore ordinario di Biochimica Agraria presso la Facoltà di Agraria della Università degli Studi della Tuscia dal 196 al 1990. Professore ordinario di Biochimica Agraria presso la Facoltà di Agraria della Università degli Studi di Firenze dal 1990. Direttore del Dipartimento di Scienza del Suolo e Nutrizione della Pianta, Università degli Studi di Firenze dal 2001 al 2007. Direttore del Dipartimento di Scienze delle Produzioni Vegetali, del Suolo e dell’Ambiente Agroforestale, Università degli Studi di Firenze dal 2010 al 2012. Direttore del Dipartimento di Scienze delle Produzioni Agroalimentari e dell’Ambiente, Università degli Studi di Firenze dal 2013 al 2016.

Membro del Senato Accademico dell’Università degli Studi di Firenze dal novembre 2012 al 2016.

E’ stato nominato Professore Eemerito della Università di Firenze. Vice-Presidente della Fondazione per il Clima e la Sostenibilità. Autore di circa 250 pubblicazioni internazionali con “Impact Factor”.

E’ editore dei seguenti libri internazionali:
1) Methods in Applied Soil Microbiology and Biochemistry (K. Alef and P. Nannipieri, eds.), Academic Press, London, 1995
2) The Rhizosphere. Biochemistry and Organic Substances at the Soil-Plant Interface (R Pinton, Z. Varanini and P Nannipieri), Marcelk Dekker, New York, 2001
3) Nucleic Acids and Proteins in Soil (P Nannipieri and K Smalla), Springer Verlag, Heidelberg, 2006
4) The Rhizosphere. Biochemistry and Organic Substances at the Soil-Plant Interface (R Pinton, Z. Varanini and P Nannipieri), Second edition, CRC Press, Boca Raton, FL 2007.
5) Omics in Soil Science (Nannipieri P, Pietramellara G, Renella G, eds) Caster Academic Press, Norfolk, UK, 2013
6) The future of Soil Carbon (Garcia C, Nannipieri P, Hernandez T, eds), Elsevier, Cambridge, MA, 2018.
7) Modern Soil Microbiology 3rd edition (Van Elsas JD, Rosado AS, Nannipieri P, Trevors J, eds) CRC Press, Boca Raton, FL, 2019.

Inserito dalla Thomson Reuters tra “The World’s most influential scientific minds”, che individua i ricercatori scientifici più citati nel mondo, a partire da una base stimata in circa 9 milioni di studiosi, dal 2015 ad oggi.

Editore Capo della rivista “Biology and Fertility of Soils”, Springer (impact factor 5,51 nel 2024) dal 2000 ad oggi. Presidente della Società Italiana di Chimica Agraria (2002-2002). E’ stato invitato a numerosi convegni internazionali a tenere presentazioni ad invito. E’ stato membro di commissioni internazionali per la valutazione della ricerca e per a selezione di progetti internazionali.

Le sue principali linee di ricerca:
Il DNA extracellulare nel suolo ed il suo ruolo negli scambi genetici;
Attività enzimatica nel suolo e lo stato degli enzimi extracellulari;
Il destino del fertilizzante azotato nel sistema pianta/suolo;
Le proteomica del suolo;
La rizosfera e la nutrizione delle piante.